Q:检测原理
A:细胞在发生凋亡时,会在生理生化和细胞形态上发生一系列变化,在凋亡中晚期,激活的DNA内切酶会切断核小体间的基因组DNA,DNA会被降解成为约180bp-200bp 的片段,而正常或者增殖细胞很少发生DNA断裂。利用这个差异,用脱氧核糖核苷酸末端转移酶(TdT 酶)把Biotin标记的dUTP标记到断裂DNA片段的3’-OH 末端,用POD检测标记并用底物显色,然后进行显微镜观察
Q:检测方法
A:显微镜
Q:样本类型
A:石蜡包埋组织切片、组织冰冻切片、细胞涂片以及贴壁细胞
Q:储存条件
A:试剂盒需储存在-20℃非无霜冰箱中,避免反复冻融。建议分装保存Biotin-标记反应混合物
Q:自备试剂
A:1.石蜡切片自备试剂:PBS溶液、二甲苯;
浓度梯度分别为70%、80%、90%、100%的乙醇溶液;
每个样本需要100µL 20µg/mL的蛋白酶K溶液,用PBS配制;
含0.1% Triton X-100和2mg/mL BSA的PBS溶液;
含3%BSA的PBS溶液(选用步骤)。
2.组织冰冻切片自备试剂:PBS溶液;
含4%多聚甲醛的PBS;
每个样本需要100µL 20µg/mL的蛋白酶K溶液,用PBS配制;
含0.1% Triton X-100和2mg/mL BSA的PBS溶液;
含3%BSA的PBS溶液(选用步骤)。
3.固定细胞片自备试剂:与冰冻组织切片同。
Q:固定样品需要准备什么
A:固定样品,需自备多聚甲醛
Q:Tunel反应液配制后用不完可以保存继续使用吗
A:TUNEL反应液即用即配,不要配制好后存放
Q:POD反应液配制后如何保存
A:POD反应液用POD贮液和POD稀释液即用即配,配制好后可以4℃保存(3个月),POD可以-20℃保存
Q:我需要检测石蜡切片,是否需要预处理
A:如果用于石蜡切片的检测,需用蛋白酶K,二甲苯处理
Q:如何固定悬浮细胞
A:悬浮细胞可用以下方法固定或贴附在玻片上:4°C 缓慢离心(1000rpm)5分钟,去除细胞培养上清,并将细胞重新悬浮在4%的甲醛溶液(溶于1×PBS 溶液)使其终密度为1×106/ml,室温孵育10 分钟。按照上述方法离心收集细胞,去除固定液并用80%乙醇溶液以相同细胞密度重悬。固定后的细胞可以保存在4°C。固定后的细胞(100-300μl)可直接固定在玻片上,使用聚L-赖氨酸包被的玻片可以提高细胞的黏附性
一、石蜡包埋组织切片处理流程
Q:样本如何脱蜡
A:1、室温下将石蜡组织切片放入二甲苯中浸泡5分钟。更换新的二甲苯再浸泡5分钟以彻底脱掉石蜡。
2、室温下用100%乙醇浸泡切片5分钟,更换新的100%乙醇再浸泡5分钟。
3、室温下用梯度乙醇(90、80、70%)各浸洗1 次,每次2分钟,逐渐增加水分。
4、用PBS 轻轻润洗切片,并用滤纸小心吸干玻片上样本周围多余的液体。这时可用石蜡笔或疏水笔在样品周围描绘样品分布的轮廓,便于下游透性处理和平衡标记操作。
注意:在实验过程中,切勿让样品干燥。处理好的样本放在湿盒中保持样本的湿润
Q:如何增加样本的通透性
A:1、用PBS溶液配置终浓度为20μg/ml的蛋白酶K(不含DNase活性),每个样本需要100μL 蛋白酶K 溶液。
2、每个样本上滴加100μL 浓度为20μg/ml 的蛋白酶K溶液,使其被全部覆盖,室温孵育20分钟。
3、用PBS 溶液润洗样本三次。
4、轻轻去掉多余液体,并用滤纸小心吸干载玻片上样本周围的液体。处理好的样本放在湿盒中保持样本的湿润。
Q:孵育时间没有把握好,有没有影响
A:注意:严格控制孵育时间,孵育时间过长可对细胞造成一定的伤害,过短则可能造成透性处理不充分,影响标记效率。蛋白酶K工作液的使用浓度、处理时间及温度因组织或细胞的类型或固定方法的不同而有所不同,使用者可参照试剂盒提供的标准使用说明摸索最合适的实验条件。
Q:如何配置标记反应液
A:
组分比例 | 1个样品 | 10个样品 | 20个样品 |
Biotin-标记反应混合物 | 48 uL | 480 uL | 960 uL |
TdT 酶(25x) | 2 uL | 20 uL | 40 uL |
标记反应液 | 50 uL | 500 uL | 1000 uL |
Q:标记反应液用不完能否储存
A:标记反应液应充分混匀,并且一次用完,不能储存,所以应该酌量配置。
Q:标记反应
A:1、洗涤样品一次,轻轻吸干样本周围的缓冲液,注意不要触碰到样本。
2、在每个样本上立即滴加50μl上述准备的TdT 标记反应混合物。
3、用预先裁剪好的比样本稍大的Parafilm®封口膜覆盖样本。
注意:可将封口膜折起一角以便于取放。封口膜的使用不仅可以确保反应混合物的均匀分布,也能减少孵育过程中的液体蒸发。
4、将切片置于湿盒中于37℃孵育60-90分钟。
Q:显色与结果评断
A:1、移走Parafilm®封口膜,并将切片置于PBS溶液中室温孵育1分钟。
2、轻轻去掉多余液体,换用新鲜的PBS 溶液室温孵育1分钟。
3、用滤纸轻轻擦掉样本周围及背面的PBS溶液。
注意:为了降低背景,载玻片在用PBS洗一遍之后,可再用含0.1% Triton® X-100和 2mg/ml BSA的PBS洗三次,每次5分钟,这样游离的未反应的标记物可以清除较干净。
4、洗涤样本,将载玻片浸入去离子水中,室温放置5分钟。重复两次,总共洗三次。
可选:用3%BSA PBS封闭样品,室温放置20分钟。
5、滴干载玻片上多余的水并且用吸水纸擦拭细胞周边的区域。
6、用POD稀释液,配制POD溶液(1:25-50稀释),在每个样本上滴加50uL POD溶液,37℃放置30分钟。
7、DAB显色液A和B混合用PBS稀释成1X工作液。PBS洗涤载玻片3次后,加入50-100uL DAB底物或者其他POD底物,室温放置10分钟。
8、PBS洗涤载玻片3次,除去多余底物后,显微镜下分析样本。
二、组织冰冻切片处理流程
Q:操作流程与石蜡包埋组织切片的有何不同之处
A:该操作流程与石蜡包埋组织切片相似,除了将脱蜡步骤替换为固定和短暂的水化步骤,并将蛋白酶K 的处理时间缩短到10 分钟。在进行该实验检测前需固定冰冻组织。为了避免在清洗步骤中的样本在玻片上损失,建议不用洗瓶清洗,而是将玻片浸在PBS溶液中2-3 次进行清洗。
注意:在操作中避免样本干燥!!!
Q:组织固定与水化
A:1、将玻片浸没在4%多聚甲醛溶液(溶于PBS)中,室温孵育15 分钟。
2、轻轻去掉多余液体,并用滤纸小心吸干载玻片上样本周围的液体。
3、将玻片浸没在PBS 溶液中,室温孵育15 分钟。
4、轻轻去掉多余液体,并用滤纸小心吸干载玻片上样本周围的液体。这时可用疏水笔在样品周围描绘样品分布的轮廓,便于下游透性处理和平衡标记操作。
Q:增加样本通透性
A:将蛋白酶K的处理时间缩短到10分钟,其他步骤同于石蜡包埋组织切片处理流程
Q:固定细胞片处理流程
A:该操作流程与冰冻组织切片相似,除了将蛋白酶K 的处理时间缩短到5分钟。将悬浮细胞固定到玻片上的操作请参考“注意事项”章节。为了避免在清洗步骤中的样本在玻片上损失,建议不用洗瓶清洗,而是将玻片浸在PBS溶液中2-3次进行清洗。注意:在操作中避免样本干燥
Q:设立阳性对照
A:1、DNaseⅠ溶液配置:3000U/ml或者1mg/ml in PBS, 1mM MgSO4 and 1mg/ml BSA
2、取经过预处理(已完成固定和通透性处理)的细胞,用DNaseⅠ处理,室温孵育10分钟
Q:设立阴性对照
A:在配置E中的标记反应液时,不加TdT酶
Q:试剂盒组分Biotin-标记反应混合物(Biotin-LABELING REACTION MIX)的作用
A:Biotin-dUTP和未标记的dNTP以最佳的比例混合,在末端脱氧核糖核苷酸转移酶(TdT 酶)的作用下标记DNA 3’-OH 末端
Q:试剂盒组分TdT (TdT ENZYME)的作用
A:将标记和未标记的脱氧核糖核苷酸掺入断裂的DNA 3’-OH 末端
Q:试剂盒组分POD (25x)的作用
A:SA-HRP,用于结合Biotin-DNA,并通过HRP催化底物显色
Q:试剂盒组分POD稀释液的作用
A:用于稀释POD
Q:试剂盒组分蛋白酶K浓度
A:1mg/ml
Q:非特异性染色,有些细胞或组织,核酸或者聚合酶活性水平较高,导致出现非特异性光标记
A:取细胞或组织后立即固定,以阻止这些酶导致假阳性,或者用ddUTP和dATP封闭样品
Q:非特异性染色,样品包埋或者固定过程中,由于试剂原因或者方法不当,造成DNA断裂
A:更换试剂或者改变包埋固定方法
Q:非特异性染色,TUNEL反应时间过长,或细胞或组织表面不能保持湿润,也可能出现非特异性染色
A:注意控制反应时间,或者减少TdT用量(标准量的20-50%),并始终确保样品湿润
Q:非特异性染色,内源性POD液可能会影响背景
A:在样品通透处理前,用3%H2O2的甲醇浸泡样品10分钟
Q:非特异性染色,POD非特异结合
A:用3% BSA的PBS封闭样品,室温10分钟,或者POD溶液比标准量稀释2-3倍后使用
Q:背景很高,支原体污染
A:请使用支原体染色检测试剂盒检测是否为支原体污染
Q:背景很高,高速分裂和增殖的细胞,有时也会出现细胞核中的DNA断裂,产生较多3’-OH 末端
A:凋亡晚期检测,同时减少TUNEL反应时间,以提高信噪比
Q:背景很高,TUNEL反应过强
A:减少TdT的用量至标准量的20-50%
Q:标记效率低,样品固定时间过长,导致交联程度过高
A:适当减少固定时间,或者采用2%多聚甲醛溶液(溶于PBS)
Q:标记效率低,组织样品通透不足
A:延长孵育时间,或者提高孵育温度,尝试0.1M柠檬酸钠60℃处理30分钟
Q:什么是通透性?增加通透性的作用?
A:通透性是破坏细胞或者组织完整结构,使DNA暴漏。
Q:石蜡样品中,需添加蛋白酶K,蛋白酶K的作用?
A:蛋白酶K在组织样品通透处理中作用非常关键
Q:POD稀释液1:25-50稀释,对于稀释比例有无建议?
A:初次实验可以直接1:25稀释
Q:如何看阳性/阴性对照的结果?
A:阴性对照为无任何染色,阳性对照为可见大量点状沉淀
Q:用DAB显色后会有什么结果?
A:DAB显色后会有点状褐色沉淀
Q:DAB自备是否有什么要求?
A:常规DAB显色液即可
Q:DAB显色背景高
A:DAB显色没有过强或者过弱之说,可能出现情况是背景高,背景高的原因是POD浓度过高或者POD反应之后洗片子不充分
Q:所用仪器显微镜为光学显微镜,没做过Tunel实验,不知是选择FITC还是POD
A:根据所用仪器选择,如果是荧光显微镜建议用FITC的好。另外流式细胞仪也用FITC,光学显微镜用POD
Q:Tunel (POD)做冰冻切片,固定时间较长,70度0.5h的抗原修复但是假阳性太多,是否需要进行修复?一抗是否可4°过夜?
A:TUNEL的原理是dUTP与断裂的DNA上的3‘OH结合,不需要做抗原修复;第一次TUNEL反应只需37度反应1h,或者延长时间即可。
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