Q:这种直接PCR试剂盒,扩增产物可以做哪些实验
A:PCR的产物可以通过琼脂糖凝胶电泳和EB染色进行分析,进行下游的常规操作,例如限制性酶切、DNA测序、dHPLC分析等
Q:适用样品
A:酵母、真菌和霉菌等
Q:模板制备需要多久
A:10min内完成模板制备,无需DNA抽提,样品处理快键
Q:可以应用于哪些领域
A:1、人类、其他哺乳动物和鸟类基因分析;2、可用于常规检测:限制性酶切、琼脂糖凝胶电泳/EB染色、荧光毛细管电泳、DNA测序或dHPLC分析
Q:是否需要去除其他RNA、蛋白等
A:提取的DNA可以马上用于PCR反应,不需要去除其他蛋白、RNA或者次生代谢产物,满足快速检测的需要,特别适合大规模基因检测
Q:样品预处理
A:直接挑取单克隆进行PCR;或采用简单预处理步骤:1、用枪头或牙签取单克隆,投入40ul预处理液中,95℃水浴10min,10000rpm离心1min,取1-4ul上清进行PCR;2、取酵母培养液,离心,吸除培养基,加入20ul预处理液,煮沸2-3min,取1-4ul样品进行PCR,剩样保存在-20℃
Q:反应体系
A:以40ul体系示例(20-50ul/reaction),在微量离心管中加入以下各种成分
酵母裂解液 | 1-2.5ul |
聚合酶 | 1-2ul |
5*PCR Buffer | 8ul |
dNTP(10mM) | 0.8ul |
Primers | 1-2ul(0.25-1uM终浓度) |
ddH2O | UP to 40ul |
Q:PCR反应参数设置
A:依据扩增产物而定,以2kb的扩增产物为例:94℃ 4 min,35 cycles(94℃ 30 sec,55℃ 30 sec,72℃ 1 min),72℃ 5 min,4℃soak。
Q:我的片段大小<1kb
A:扩增1kb以下片段,30 sec延伸即可;也可采用两步扩增法(设计引物长度22-25bp,68℃退火延伸)
Q:转化子鉴定
A:鉴定转化子可以直接挑取单克隆座位PCR模板,但细胞量不能太多,最好控制在10000个细
Q:裂解液使用量是否有要求
A:聚合酶可以耐受最高10%(V/V)的裂解液,过量裂解液会对PCR反应产生抑制并对下游产物分析产生不利影响,大多数情况加入2-5%(V/V)酵母裂解液可以完成PCR反应
Q:如何确认加入模板的最佳范围
A:初次实验,建议加入1%、2.5%和5%(V/V)酵母裂解液
Q:反应为阴性,跟dNTP有关吗
A:dNTP容易失效,反应为阴性时,建议增加dNTP用量,或者更换新鲜制备的dNTP
Q:细菌或霉菌样品如何操作
A:酵母PCR试剂盒可以用于细菌、霉菌或者其他真菌的免抽提PCR,方法一样
Q:每次反应多少细胞量
A:本酶灵敏度很高,每次反应500-20000细胞PCR反应最佳
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